Urodził się w 1937 r. Studiował u braci Wincentego i Leona Śliwińskich.
Był utalentowanym śpiewakiem operowym i w latach 50. występował w Operze Narodowej w Warszawie.
Potem zajął się malarstwem i w latach 1962-1967 brał udział w wystawach na warszawskim Barbakanie. Uczestniczył w wielu wystawach międzynarodowych m.in. w 1963 r. w Biennale Mostra Internazionale Antoniana di Pittura e Scultura w Padwie. W latach 1972-1976 brał udział w pokazach promocyjnych zorganizowanych w Belgii i Holandii przez firmę Prokonsys, gdzie prezentował swoje prace ze znanym holenderskim artystą Karelem Appelem. W 1981 r. wystawiał w Turo w Cornwalii na imprezie zorganizowanej przez Cultural and Leisure Complexes. Natomiast w 1985 r. odbyła się jego indywidualna wystawa w Bergisch Gladbach podczas imprezy „Warschau Aktuell”. Obrazy Jana Wagnera znajdują się w prywatnych kolekcjach w kraju i zagranicą, w wielu galeriach i muzeach m.in. w Selected Artist Galleries w Nowym Jorku, Miami, the Art. Gallery of Toronto, Grange Park w Canadzie i Anna Lewin w Londynie, Jan Kleinewefers Sammlung. Zmarł w 1988 r. w Warszawie.
Artysta malował w technice olejnej i akrylowej. Tematyka jego prac mieści się gdzieś miedzy światem realnym a fantazją, z jednej strony rzeczywista z drugiej ociera się o abstrakcje. Z trudnych do zinterpretowania form wyłaniają się przedziwne kształty zdeformowanych zwierząt oraz przerażonych twarzy. Mroczność obrazów potęgują ostre kolory na tle ciemnej przestrzeni.